وبلاگ

در این مطالعه از وسایل و مواد زیر استفاده شد:

 

• • میکروسانتریفیوژ (توماس)

 

• • تانک الکتروفورز (پدیده نوژن پارس)

 

• • منبع تغذیه جریان الکتریکی^[۹] (پدیده نوژن پارس)

 

• • ورتکس – اسپین (کیاژن)

 

• • دستگاه PCR پرسونال و گرادیانت (a&e انگلیس)

 

• • اتوکلاو (rozhin teb)

 

• • Gel documentation(کیاژن)

 

• • ترازو (A & D)

 

• • سمپلر lµ ۱۰-۵/۰، lµ ۱۰۰-۱۰، lµ ۱۰۰۰-۱۰۰ (واتسون)

 

• • سر سمپلر کریستالی ، آبی ، زرد

 

• • دستکش لاتکس (Home care)

 

• • دستکش یکبار مصرف

 

• • میکروتیوبcc 2/0، ۵/۰ ، ۵/۱ و ۲

 

• • آگارز (سیناژن، ایران)

 

• • Tris-HCL (Merck، آلمان)

 

• • کیت استخراج DNA ( ATP ایران)

 

• • ^[۱۰]EDTA (Merck، آلمان)

 

• • Taq DNA polymerase (سیناژن، ایران)

 

• • dNTP Mix 10mM (سیناژن، ایران)

 

• • ۱۰x PCR buffer (سیناژن، ایران)

 

• • AMS^[11] ۱۰X PCR buffer(سیناژن ایران)

 

• • MgCl₂ ۲۵mM (سیناژن، ایران)

 

• • هیدروکسید سدیم (Merck، آلمان)

 

• • بوریک اسید (سیناژن، ایران)

 

• • DNA Stain (کیاژن)

 

• • اتانول (Merck، آلمان)

 

• • کلروفرم (Merck، آلمان)

 

• • DNA Ladder bp 100(سیناژن، ایران)

 

• • Loading buffer (سیناژن، ایران)

 

• • لوله های CBC 5/2 سی سی حاوی EDTA

 

• • سرنگ ۵ سی سی

 

• • پرایمر (ماکروژن، کره جنوبی)

 

• • آب مقطر استریل

 

۳-۲- نوع مطالعه
این تحقیق یک مطالعه تحلیلی- مشاهدهای و از نوع مورد- شاهدی گذشته نگر می‌‌‌‌‌‌‌‌باشد.
۳-۳- جامعه آماری و نمونه گیری
جامعه آماری این مطالعه را افراد مبتلا به سرطان معده تشکیل می‌دهد که توسط پزشک، بیماری آن‌ها تایید شده و نمونه خون آن‌ها در دسترس باشد. مبتلایان از افراد مراجعه کننده به بخش پرتو درمانی و شیمی درمانی بیمارستان سیدالشهداء اصفهان بودند که از ۵۲ بیمار مبتلا به سرطان معده پس از اخذ رضایت نامه به میزان ۵/۲ سی سی خون وریدی گرفته و درون لوله‌های ‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌CBC حاوی EDTA منتقل شد و سپس به آزمایشگاه انتقال داده شد و تا هنگام استخراج DNA در دمای ۲۰- درجه سانتی‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌گراد نگهداری شد. همچنین فرم پرسشنامه اطلاعات فردی توسط بیمار و به کمک پرونده پزشکی موجود در بایگانی بیمارستان تکمیل شد و این افراد به عنوان گروه بیمار در نظر گرفته شدند. از ۵۲ فرد سالم اهدا کننده خون در سازمان انتقال خون که از لحاظ سن (۵±) و جنس با گروه بیمار، همسان سازی شده بودند، به عنوان گروه کنترل (یا گروه شاهد) نمونه خون تهیه گردید.
در این مطالعه دو پلی‌مورفیسم تک‌نوکلئوتیدی در پروموتر ژن GKN1 با شناسه‌های rs4575760 و rs4072127 بررسی شد. اکثر افراد بررسی شده برای تعیین ژنوتیپ این دو پلی‌مورفیسم مشترک بودند اما بعضی از افراد فقط برای rs 4575760 و بعضی دیگر فقط برای rs 4072127 مورد بررسی قرار گرفتند. بنابراین برای مشخص کردن این تفاوت، افرادی که برای پلی‌مورفیسم rs 4575760 و rs4072127 مورد بررسی قرار گرفتند به ترتیب با جمعیت A و B نشان داده شده است.

۳-۴- رضایت نامه
از تمامی افراد شرکت کننده در این مطالعه رضایت نامه کتبی گرفته شد.
۳-۵- روش تهیه محلول‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ مورد نیاز جهت انجام الکتروفورز
۳-۵-۱- بافر الکتروفورز (۱۰ X) TBE در حجم ۵۰۰ میلی لیتر
مواد مورد نیاز:

 

• • Tris-base 5/27 گرم

 

• • بوریک اسید ۵۴ گرم

 

• EDTA 15/2 گرم